PEDを用いたヒトの多型解析例

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ここでは、Illumina社が解析して公開したプラチナゲノムの配列データの多型の検出を例に、Linux(Ubuntu)のインストール、PEDのセットアップ、ゲノムブラウザでの結果の表示の方法を紹介します。

ERR194146ERR194147の配列データを例に解析手順を紹介します。

Ubuntuのインストール

PEDのセットアップと解析例

Dockerでの解析

IVGブラウザによる結果の確認

PEDに関する資料

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